Το 1959, σε ηλικία μόλις 17 ετών μεταγράφικε στην ομάδα της Βέροιας, όπου και αμέσως καθιερώθηκε. Το 1962 πήρε μεταγραφή στην ΑΕΚ έναντι 175.000 δραχμών.
Με την ΑΕΚ αγωνίστηκε επί 17 συνεχείς περιόδους και μαζί της γνώρισε μεγάλες διακρίσεις. Κατέκτησε πέντε πρωταθλήματα Α΄ Εθνικής (1963, 1968, 1971, 1978, 1979) και τρία κύπελλα Ελλάδας (1964, 1966, 1978). Επίσης, αναδείχθηκε δύο φορές πρώτος σκόρερ (1964, 1966) και ήταν βασικός συντελεστής σε δύο εντυπωσιακές πορείες της ομάδας στα ευρωπαϊκά κύπελλα, το 1968-69 στο Κύπελλο Πρωταθλητριών και το 1976-77 στο Κύπελλο ΟΥΕΦΑ.
Ύστερα από ένα φιλικό ανάμεσα σε ΑΕΚ και Ρεάλ Μαδρίτης στη Νέα Φιλαδέλφεια τον Μάιο 1965 το οποίο έληξε στο 3-3, με τον Παπαϊωάννου να σημειώσει τα δύο απ' τα τρία γκολ του "Δικεφάλου", τράβηξε το ενδιαφέρον της Ρεάλ.
Τον Οκτώβριο του 1965 η ΑΕΚ δέχθηκε πρόταση, μέσω του Ραϊμούντο Σαπόρτα, από τη Ρεάλ Μαδρίτης ύψους 4.000.000 δραχμών, και 750.000 δραχμές στον ποδοσφαιριστή, αλλά ο αθηναϊκός σύλλογος την απέρριψε.
Η απόφαση στεναχώρησε ιδιαίτερα τον Παπαϊωάννου, ο οποίος έβλεπε την μεγαλύτερη ευκαιρία της ζωής του να χάνεται.
Γι' αυτό το λόγο, αποφάσισε να σταματήσει, ακολουθώντας τον φίλο του, Στέλιο Καζαντζίδη και την Μαρινέλλα σε μία δίμηνη περιοδεία στη Δυτική Γερμανία. Ο Παπαϊωάννου είχε μία εξαιρετική σχέση με τον λαϊκό τραγουδιστή, ο οποίος ήταν κι αυτός που τελικά μεσολάβησε λίγο καιρό αργότερα προκειμένου να επιστρέψει στην ΑΕΚ με 500.000 δραχμές.
Το 1979 σταμάτησε να αγωνίζεται στην Ελλάδα έπειτα από 480 αγώνες πρωταθλήματος.
Πέτυχε 234 γκολ, ρεκόρ για την εποχή που κατέρριψε ο συμπαίκτης του Θωμάς Μαύρος 11 χρόνια αργότερα. Μέχρι σήμερα κατέχει την έκτη θέση σε συμμετοχές και την τρίτη θέση στους σκόρερ στην Α΄ Εθνική. Είναι δε στην πρώτη θέση στους σκόρερ με την ίδια ομάδα.
Τη χρονιά εκείνη μετέβη στις ΗΠΑ, όπου αγωνίστηκε για μια περίοδο στον Παγκύπριο Νέας Υόρκης ως παίκτης-προπονητής και κατάφερε να κατακτήσει το νταμπλ στο τοπικό πρωτάθλημα και κύπελλο. Αν και πλησίαζε τα 40 προσέλκυσε το ενδιαφέρον της κορυφαίας επαγγελματικής λίγκας των ΗΠΑ, της NASL, αλλά πλέον είχε αποφασίσει να σταματήσει.
Ο Παπαϊωάννου αγωνιζόταν στην αριστερή πτέρυγα της επίθεσης, πάντα με το νούμερο 10. Με τον ερχομό του Μαύρου το 1976, οπισθοχώρησε σε θέση, περισσότερο ως επιθετικός μέσος, κάτι που συχνά συνέβαινε και στην εθνική ομάδα.
Είχε μεγάλη ευχέρεια στο σκοράρισμα, συνήθως με το αριστερό πόδι, διακρινόμενος για τις σωστές τοποθετήσεις του στην περιοχή. Παρά το χαμηλό του ύψος, σημείωνε γκολ και με κεφαλιές χάρη στην αλτικότητά του. Διετέλεσε επί σειρά ετών αρχηγός της ΑΕΚ και της εθνικής ομάδας, ενώ το ήθος του παραμένει αξιομνημόνευτο.
Μετά το τέλος της αγωνιστικής του καριέρας επεδίωξε να εργαστεί ως προπονητής ξεκινώντας από τον Παγκύπριο Νέας Υόρκης και κατόπιν σε διάφορους συλλόγους όπως στον Α.Ο. Κέρκυρα (1986-87), στον Εδεσσαϊκό (1987-88), στην Α.Ε. Κως (1989-90), στον Εύγερο Φαρακλάτων Κεφαλονιάς, στον Πανναυπλιακό κ.ά.
Υπήρξε συνεργάτης του Αλκέτα Παναγούλια στον πάγκο της Εθνικής Ελλάδας στο Παγκόσμιο Κύπελλο του 1994 στις ΗΠΑ.
Δείτε φωτογραφίες που έφερε στη δημοσιότητα η dikefalhistoria.gr:
Ο άνθρωπος, που έκανε όλη τη Βέροια να υποστηρίζει ΑΕΚ
ΑπάντησηΔιαγραφήΘα ήθελες πολύ !!Η πολη και όλη η περιοχή είναι ΠΑΟΚ !!Σιγά να μην υποστηρίζαμε χάρτινους !!Εκτός από την περιοχή της Μπρανιάτας όπου ήταν και ο τόπος καταγωγής του Παπαϊωάννου όλη η υπόλοιπη Ημαθία ήταν και είναι ασπρόμαυρη.Εκει στη Μορανιατα νόμισαν ότι έπαιζαν αυτοί στην αεχ.Τοσο κόβει ..
ΔιαγραφήΜεγάλη τιμή να υποστηρίζει η Βέροια και η γύρω περιοχή φονιάδες Παοκτσήδες . Στλιάρια ε στλιάρια, gao, ouga, ouga.
ΔιαγραφήΤο γκυφτο το 1:28 έμαθε να γράφει ,και νομίζει ότι όλοι είναι γκυφτοι.
Διαγραφή20 Αυγούστου 2024 στις 1:28 μ.μ......Λάθος κάνεις , από τον Παπαϊωάννου τότε γίναμε ΑΕΚ , για πολλά χρόνια !
ΔιαγραφήΤι γράφεται ρε; Η Ημαθία είναι Βυσσινή και μπλε! ΠΑΡΤΕ ΤΟ ΧΑΜΠΑΡΙ!
ΔιαγραφήΤιμή στο ανθρωπο που έκανε όλη τη Μακεδονία ΑΕΚ
ΑπάντησηΔιαγραφήΗ Ημαθία είναι βυσσινή και μπλε! ΠΑΡΤΕ ΤΟ ΧΑΜΠΑΡΙ!
ΔιαγραφήΦονιάδες είναι αυτοί που έφαγαν το Μιχάλη και φορούσαν ίδιο κασκόλ με αυτόν .Μάντεψε τι κασκόλ φορούσαν !! Άιντε γενίτσαροι του ΠΟΚ Γιουσοφακια...
ΑπάντησηΔιαγραφήΑπό που προκύπτει αυτό? Έχεις στοιχεία? Αν έχεις μπορείς να τα πας στον εισαγγελέα, να κλείσει η υπόθεση. Αν δεν έχεις είσαι απλά συκοφαντης
ΔιαγραφήΜονο περηφάνια για τον άνθρωπο που έκανε την ΑΕΚ τη λαοφιλεστερη ομάδα στην Ημαθια
ΑπάντησηΔιαγραφήΗ Ημαθία είναι Βυσσινί και μπλε! ΠΑΡΤΕ ΤΟ ΧΑΜΠΑΡΙ!
ΔιαγραφήΗ ημαθια είναι το κάστρο της ΑΕΚ στην κατακίτρινα Μακεδονία, κυρίως λόγω Παπαιωαννου
ΑπάντησηΔιαγραφήΗ Ημαθία είναι Βυσσινί και μπλε! ΠΑΡΤΕ ΤΟ ΧΑΜΠΑΡΙ!
Διαγραφή